2001年5月，在北京召开的21世纪世界自然医学大会上，由联合国世界和平基金会主席刚坚倡议和领导，发表了《建立联合国世界自然医学组织（WNMO）宣言》，成立了世界自然医学组织。从此开创了人类顺应自然、运用自然医学来全方位地保护人类身心健康的新里程碑。
◇努力实现联合国卫生组织提出的“人人享有卫生保健”的目标。
◇努力实现世界卫生组织（WHO）的健康定义，“健康不仅是没有疾病，而且是真正达到身体上、心理上和社会生活上顺应自然规律的平衡。”
◇促进21世纪世界自然医学的发展和进步，推进世界各国自然医学工作者的联合和协作，共同创建21世纪统一的自然医学体系。
◇保护生命，实现安南箴言，“要使地球得到真正的和平，就必须对我们行星上丰富多彩的生命进行保护和养育，而不是威胁和破坏。”
◇遵守并实现世界21世纪科学的基本准则：人类的和平事业高于一切，科学必须完全为和平服务；尊重人的尊严和权力； 尊重并保护地球其他生命形式和生态系统；科学知识应该被合理地分享和传播。
世界自然医学组织总部设在意大利米兰Via Marco Polo 13，20124，Milan，Italy。美国总部注册地250 Aibany Street，Springfield，MA01105，USA。主席刚坚．洛桑士旦．赤列雅培仁波切。
世界自然医学组织遵守联合国相关组织章程和法规；响应世界卫生组织（WHO）大力发展自然医学的号召，执行WHO制定的传统医学，即自然医学战略；继承和总结自然医学的丰硕成果，结合现代生命科学的成功模式和方法，顺应自然，返璞归真，以人为本，开发自然医药和人体潜能；实现联合国提出的“人人享有卫生保健”的社会目标，争取在21世纪达到“人尽天年”的世界理想。
总部设执行局，执行主席和委员由总部主席任命。执行局下设组织委员会、基金委员会、科学委员会、教育委员会、顾问委员会和自然医学研究院等机构，均由总部主席授权和任命。
为了促进与发展21世纪世界自然医学，世界自然医学组织总部成立世界自然医学集团有限公司，并在条件成熟时建立系统的自然医学医院、疗养院、康复中心、保健中心、国际交流中心；国际自然医学大学、研究院、特医研究所；自然医学研究开发基地、生产基地、种植基地、自然保护绿色示范基地、药厂；世界自然医学组织档案馆、自然医学成果展示馆、自然医学网上图书馆等。大力发展自然医学，建立现代医学与自然医学相结合的21世纪世界崭新医学体系。
